Налоговики начали все активнее использовать новый способ лишения налогоплательщиков права на упрощенку. Если у компании есть обособленное подразделение, она должна быть готова, что ИФНС попытается признать его филиалом и запретить применять спецрежим.
В статье разбираем судебный акт, который был вынесен в пользу налогового органа, чтобы вы смогли оценить, попадаете ли в зону риска (с огромными доначислениями).
На рассмотрение Девятого арбитражного апелляционного суда попал интересный спор об оценке параметров созданного подразделения компании с точки зрения его квалификации как филиала или просто обособленного подразделения (постановление Девятого арбитражного апелляционного суда от 08.12.2025 № 09АП-44045/2025 по делу № А40-24563/2025).
Вопрос имеет принципиальное значение, поскольку это напрямую влияет на законность или необоснованность доначислений по итогам налоговой проверки (в налоговом споре, который стал предметом нашего пристального внимания, сумма составила более 300 млн рублей).
Суть к незаконности, по мнению ИФНС, применения налогоплательщиком в проверяемом периоде упрощенной системы налогообложения 1.
Напомним: согласно подп. 1 п. 3 ст. 346.12 НК РФ организации, имеющие филиалы, применять УСН не вправе. А в рамках проверки налоговая инспекция пришла к выводу, что созданное структурное подразделение имело признаки филиала, что и явилось основанием для доначислений.
Подтверждает данную позицию и Минфин России.
Фрагмент документа
Письмо Минфина России от 05.06.2023 № 03-11-06/2/51477
…организация, применяющая упрощенную систему налогообложения, при создании филиалов не вправе применять данную систему налогообложения. При создании обособленных подразделений, не являющихся филиалами, такая организация вправе продолжить применение упрощенной системы налогообложения…
Отличие филиала от представительства
Для оценки обстоятельств данного дела прежде всего необходимо обратиться к базе: нормам гражданского и налогового законодательства.
С точки зрения гражданского законодательства представительство и филиал – это обособленные подразделения юридического лица, расположенные вне места его нахождения, однако:
- представительство только представляет интересы юридического лица и осуществляет их защиту, а
- филиал, помимо этого, выполняет все или часть функций юрлица.
Филиалы и представительства юридическими лицами не являются. Они наделяются имуществом создавшим их юридическим лицом и действуют на основании утвержденных им положений. Руководители представительств и филиалов назначаются юридическим лицом и действуют на основании доверенности (ст. 55 ГК РФ).
С точки зрения налогового законодательства обособленное подразделение – это любое...